物理學系大學部成立於民國86年，民國90年成立應用物理碩士班，博士班於民國92年成立，現任專任教師共18人，技術師1人及行政助理2人。為因應高科技產業對奈米光電與物理人才的需求，並維持物理系競爭力，於98學年度起擴大招收大學部學生共60名，招生方式分成「奈米與光電科學組」20名及 「物理組」40名之兩組，且大學部課程採學程化設計，除物理基礎必修學程外，專業選修學程分為奈米與光電物理學程、理論與計算物理學程及生物與材料物理學 程三大學程。 　　本系自成立以來已完成設立普通物理實驗室、大二及大三基礎物理實驗室與計算物理等教學實驗室，為有效提升學生在電子學課程的學習成效，並增加大三基礎 物理實驗的實作訓練，目前積極籌備成立應用電子學實驗，也陸續規劃各教學實驗室之間的整合，以期在資源有限條件下，達成最大教學效益。為擴充實驗教學資 源，在近年執行教育部核准的「教學卓越計畫」過程中，已完成設立第二普通物理實驗室，大幅降低普通物理實驗各班級人數；大二基礎物理實驗課程中，已新增使 用多種感應器進行測量之實驗設計，可在學習自動控制與自行組合設計實驗過程中，強化學生動手設計實驗之興趣與能力，提高教學成效。此外，部分課程利用「數 位學習平台-東華e學苑」提供的教學互動平台，學生可透過網路進行指定習作或取得補充教材自修，更增加師生互動的多樣性管道。 　　除了硬體設備隨各教學實驗室與教授研究實驗室擴充逐年成長外，本系根據教授研究教學與學生學習所需，每年編列圖書預算以採購物理相關圖書。全體師生更 可透過網路使用AIP、APS、Elsevier等出版商提供的上百種物理全文網路期刊，能夠快速地取用完整的期刊資訊。然而為因應未來數年基礎科學領域 的研究人員與學生人數逐年增加，本校將責無旁貸地向政府爭取設立宜花東地區物理圖書中心及貴重儀器中心，以落實東部地區科學教育與研究發展的基礎建設。 大學部學生參與教授研究與實驗室團隊為本系特色之一，特別鼓勵大學部學生提早接受教授指導進行科學研究，尤其可申請國科會大專生研究專題計畫；經由實作研 究經驗啟發學生的研究興趣、能力與視野，並配合本系大學部專題研究課程、書報討論、學士論文、研究成果發表與競賽等活動，包括鼓勵優秀學生參與國際會議發 表研究成果，藉由系統科學思維、解決問題與討論、表達等能力訓練，賦予本系畢業學生升學研究所或就業時的表現競爭力。 本系應用物理研究所(碩士、博士班)教育宗旨在於培育具獨立研究能力之專才，尤其重視專業整合，配合科技發展趨勢設計主題課群，以生物物理、計算物理、奈 米光電物理與凝態物理為核心領域，提供整合專業知能的訓練，滿足研究所畢業生未來在學術進修或各領域就業時的專業背景需求。本系更設有獎勵辦法鼓勵學生參 加國際學術研討會，凡獲得國科會補助者，本系將再給予額外補助，減輕其參加國際會議的負擔，提高學生出國參加會議的意願，如此可提升學生之研究與國際視 野，增加其與國外研究團隊交流與互動以及自我表現機會，有助於提升學生日後申請出國深造或就業時的競爭力與機會。 本系目前聘有實驗專業背景之專任教師共9人，理論與計算專業背景之專任教師共6人；在國科會個人研究計畫與經費方面，所有專任教師每年均申請國科會計劃 (含多年期計畫之預核案、國家奈米計畫及整合型計畫之共同主持人)，每年核准之國科會計畫平均為15.6件，平均每人每年獲得243.2萬元經費補助。本 系整體之研究表現優異，尤可見於近三年本系教師發表於SCI期刊上之論文可觀數量，2007年至2009年專任教師人數平均14.3人，每年發表SCI期 刊論文平均數35.3篇，即每人每年發表平均數2.4篇。 與國家理論科學中心合作之主題研討小組(Focus Group)，以及承辦各類暑期學校為本系具特色之學術活動。東華暑期學校(East Formosa Summer School，EFSS)始自民國92年，每年暑期選定一個研究領域為主題，邀請該領域之國內外著名學者，進駐東華進行為期一週的學術講學，藉以激發國內 相關研究領域的研究與合作，並提升研究水準。目前已舉辦4屆東華暑期學校，並於2010年承辦「第十四屆台灣核物理」暑期學校，每屆暑期學校參加人數總計 約100人，其經營與促成學術合作的影響獲得許多正面評價。另外，本系除不定期舉辦大型國際研討會外，各教師在其研究相關領域上已與東西部重點學術單位建 立實質合作關係，包括與慈濟大學、中央研究院物理所高能組及、基因體中心、複雜系統組及原分所等研究的研究合作，此合作內容亦包含執行持續進行中的許多跨 領域研究計畫。